专家组分别在哈尔滨、武汉两地听取了项目4个课题的工作汇报，并进行了现场检查。第1课题“鲤鱼等功能基因组资源开发及其数据库与网站构建”由中国水科院徐鹏负责，对鲤鱼不同品系和发育时期样品开展转录组分析，进行了基因组功能注释，共发现52610个蛋白编码基因，从基因组尺度证明了鲤鱼四倍化后的基因倍增现象。对鲤鱼代表性品系开展了全基因组重测序研究，共发掘约3500万个非冗余多态性SNP位点，设计构建了鲤鱼250K SNP芯片，该芯片的成功构建为开展基因组选择育种、全基因组性状关联分析等研究奠定了基础。课题组还构建了鲤鱼基因组数据库群和交互式网站，为数据存储、浏览和共享提供了平台。第2课题“鲤生长等经济性状的主效基因发掘及育种潜力评估”由中国水科院黑龙江所孙效文负责，建立了有4877个标记的高密度遗传图谱，为鲤基因组装配、基因注释、经济性状QTL精细定位提供了基本框架，遗传力分析表明，肌间刺为可选育性状，家系选育获得了F1代少肌间刺个体，鲤抗疱疹病毒的新品种培育取得进展，通过功能基因组鉴定到两个与抗病紧密相关的基因座，在此基础上构建出抗病力提高40%的F2代群体，利用分子标记和经济性状的主效基因培育出长型镜鲤优良品系F3代、F4代，F3代平均体长QTL富集比例较选育前的F0提高116.46%。第3课题“草鱼重要经济性状相关基因的克隆及功能验证”和第4课题“功能基因育种潜力的验证与新育种技术研究”分别由中国科学院水生生物研究所汪亚平和胡炜负责，并由中国水科院珠江水产研究所、黑龙江水产研究所的三个任务团队参与，各项研究任务均取得了良好进展。
专家组经审阅材料、现场检查和提问，对项目各课题取得的阶段性成果予以充分肯定，并就后续深化研究的方向提出了建议，鼓励项目各课题组加强重大成果的凝练和产出。项目顺利通过中期检查。
