近几十年来，日本鳗族群受到过渔、栖地破坏、气候变迁、疾病及人工构造物阻断其洄游路径等等因素，资源量大幅下降，2015年国际自然保护联盟组织 (IUCN) 把日本鳗以及美洲鳗列入红皮书的濒危物种，在三个濒危级别中属于第二等级“不久的将来野生濒危可能性较大的物种”。此后，美国与欧盟一直传出有意在2016年9月下旬在南非召开的第17届华盛顿公约（CITES） 会议上，提案讨论将美洲鳗与日本鳗列入附录二物种，藉由贸易管制保护其天然资源，提案截止日为2016年4月27日。根据欧盟于4月27日寄给华盛顿公约组织的公开信表示，欧盟此次不会提案将日本鳗列入附录二，但是提出要求，应积极调查与评估现有鳗鱼属的资源量与贸易现况，作为下届（2019年）提案与否的参考。 公开信指出，台湾、日本、中国、韩国等国共同同意的日本鳗资源管理措施 (放养量上限)，最大的问题是“违法交易情形令人相当忧心”。并指出东亚地区针对防止滥捕的管理体制并不完善。另外，由于欧洲鳗已经无法进行国际交易，现在美洲鳗以及热带鳗种在东亚地区取而代的成为需求急增的物种。因为信息不足，导致阻碍了有效的资源管理，所以具有公信力的研究及调查是必要的。 去年 (2015年)，日本、中国、韩国与台湾四国共同创立一个称之为“永续鳗鱼养殖联盟（Alliance for Sustainable Eel Aquaculture；ASEA）”的国际非政府组织，负责推动东亚各国执行鳗鱼资源的管理及养护工作，期待能有效管控日本鳗资源量。欧盟此次的要求，等于是将日本鳗是否列入华盛顿公约附录二物种的争议，宣告在下一届会议中决战。各国必须加快脚步，做好日本鳗的资源管理与养护，否则恐将难逃日本鳗被列入华盛顿公约附录二物种的冲击。
