青岛消息网记者从黄海水产研讨所获悉,日前在山东省农业良种工程等项目支撑下,黄海水产研讨所陈松林研讨员团队、中山年夜学林浩然院士团队和美国密歇根州立年夜学李伟明传授团队等,结合完成了鞍带石斑鱼(龙胆石斑)的全基因组测序和基因组图谱绘制,并解析了其先本性免疫和快速发展的基因组学机制。研讨结果在国际主要学术刊物《分子生态资本》(Molecular Ecology Resources)上在线颁发。
石斑鱼是我国主要的海水养殖经济鱼类。鞍带石斑鱼,俗名龙胆石斑、龙趸,是石斑鱼类中体型最年夜、发展最快的一种石斑鱼,具有抗病力强、发展快速、味道鲜美等特色,因而普遍利用于石斑鱼杂交育种和良种选育。作为体型最年夜的肉食性岩礁鱼类,鞍带石斑鱼对于岩礁生态体系亦具有主要影响。
研讨职员采取二代测序和HiC三维基因组技巧,构建了染色体程度的鞍带石斑鱼基因组图谱,成果显示鞍带石斑鱼基因组巨细为1.086Gb,含有24718个卵白编码基因。进化剖析和共线性剖析显示,鞍带石斑鱼与三棘刺鱼关系比来,分化时光距今约1亿年,两者的部门染色体产生了融会或***;与其他鱼类基因组的比拟基因组学剖析发明,鞍带石斑鱼具有较完美的先天免疫体系,此中一些介入先本性免疫的基因家族(如NOD-like家族)产生了明显扩大,并产生了明显的DNA序列变更(正选择);同时,一些激素旌旗灯号传导通路的要害基因亦受到正选择,可能与其发展快速的生物学特点有关。
鞍带石斑鱼基因组精致图谱的完成,为解析石斑鱼科鱼类发展、抗病等主要经济性状的分子机制奠基了主要基本;同时,鞍带石斑鱼全基因组数据也为石斑鱼杂交育种及良种选育技巧的成长供给了有价值的基因资本,对于推进石斑鱼财产的可连续成长具有主要意义。