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最新重大发现!中科院海洋所李富花课题组揭秘对虾进化中的关键因素

放大字体  缩小字体 发布日期:2022-11-17 08:04:15    来源:海鲜批发    作者:海产品批发    浏览次数:139
导读

近日,由中科院海洋所李富花课题组主导完成的科研论文“简略反复序列增进对虾基因组可塑性和顺应性进化”在Nature子刊《通信-生物学》在线颁发。该研讨针对简略反复序列在对虾基因组内呈爆发式扩大的现象,初

近日,由中科院海洋所李富花课题组主导完成的科研论文“简略反复序列增进对虾基因组可塑性和顺应性进化”在Nature子刊《通信-生物学》在线颁发。该研讨针对简略反复序列(***sequencerepeat,SSR)在对虾基因组内呈爆发式扩大的现象,初次提出SSR在基因组内急速扩大的新机制,揭示了SSR在对虾基因组的可塑性和顺应性进化进程中的要害感化。

从简略到庞杂

SSR是由1~6个碱基串联反复多次形成,在所有已测基因组物种中含量广泛较低(仅约1%摆布),并且它们凡是被以为是没有功效的,属于基因组上的“垃圾DNA”。然而,该课题组前期研讨发明凡纳滨对虾基因组SSR含量竟高达23.93%,激发了研讨职员对于SSR在对虾进化中的功效及感化机制的浓重爱好。

对虾基因组SSR扩大与顺应性进化

为了探讨SSR的散布特点和功效,研讨职员完成了另一种对虾——中国明对虾——的全基因组测序和组装,并基于Hi-C测序,构建了凡纳滨对虾和中国明对虾染色体程度的基因组图谱。经由过程比拟基因组学剖析,揣度SSR的爆发式扩大产生在对虾的祖先基因组上,而SSR的特异性扩大也呈现在分歧对虾分化之后。SSR的扩大事务也与生物年夜灭尽事务后对虾的快速进化时光一致,提醒了SSR在对虾顺应性进化进程中的要害感化。

对虾SSR扩大新机制

本研讨初次发明SSR爆发式扩大的新机制,与传统以为的复制滑动突变模子分歧,研讨职员发明对虾SSR的爆发式扩大重要与转座元件的携带有关,并进一步判定出近期活泼的转座元件,揣度其仍具有携带SSR扩大的潜能。此外,本研讨发明SSR在对虾基因组可塑性和情况顺应中具有主要感化,高密度的SSR散布引起对虾染色体内年夜范围基因组重排。

SSR介入对虾盐度顺应相干基因的表达调控

尽管中国明对虾和凡纳滨对虾亲缘关系附近,可是它们在盐度顺应才能上却存在明显差别。研讨职员初次发明对虾重要经由过程调控体内自由氨基酸的含量来调节体内的渗入压,而SSR能富集于基因调控区,介入渗入压调节要害通路的基因表达调控。这些基因表达模式的差别可能是引起两种对虾渗入压调控才能差别的主要原因。

该结果为说明生物体内SSR的功效和甲壳动物对情况的顺应进化研讨供给了新的线索,也为对虾基因组育种和分子改进供给了主要的理论基本和数据支持。(总台央视记者王伟)

 
(文/海产品批发)
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