中国海产科学研讨院长江海产研讨所李忠研讨员团队开展黄鳝基因组染色体图谱研讨，获得了首个高质量基因组参考图谱，研讨成果近日在《G3:Genes/Genomes/Genetics》杂志在线颁发。这是该团队在国内初次完成黄鳝全人工范围化繁育基本上取得的又一主要结果，为黄鳝新品种加快选育奠基了主要基本。
该研讨采取Illumina二代测序、PacBio SeqII三代测序及Hi-C技巧，联合进步前辈组装策略获得了完全持续的高质量黄鳝全基因组。基因组巨细为799 Mb（Contig N50=2.4Mb, Scaffold N50=67.24Mb），组装获得12条染色体序列，笼罩猜测基因组巨细的99.26%；判定出364802个微卫星（SSR）位点，获得287189个候选SSR标志，应用判定出的SSR标志构建了高密度物理图谱，并对部门分子标志进行了验证，分子标志的开辟和应用将极年夜加快帮助育种进程。经由过程对基因组进行剖析发明，黄鳝与年夜刺鳅在499万年前分化，随后黄鳝有769个基因家族产生了扩增，功效注释显示集中在免疫体系相干道路、感到体系如嗅觉传导、旌旗灯号传递等体系。这些发明为研讨黄鳝核型进化、表皮呼吸及其奇特性逆转特征等研讨供给了主要数据。
黄鳝是主要的淡水养殖种，2019年全国产量31.9万吨，基本产值跨越200亿元，是周全推动村落振兴计谋的主要抓手。同时黄鳝又是奇特牝牡同体、雌性先熟的性逆转鱼类，具有极高的性别研讨价值。同鳗鲡财产一样，黄鳝财产一向靠捕捞野生苗种进行再养殖，财产始终困于资本量无法扩展；人工滋生瓶颈的制约，也限制了基本科学研讨推动。近年来，李忠研讨员开展了全人工范围化繁育研讨，于2019年经由过程长江所和仙桃市国民当局组织的11家讲授/科研单元专家团队的现场验收。相干研讨结果在湖北仙桃和四川宜宾开展了财产示范，取得了极好的示范后果和财产影响，开启了科研和财产进级之路。
今朝，黄鳝种质资本混淆，有黑斑鳝、黄斑鳝、灰鳝等。年夜黄斑鳝背部三条纹、腹部金黄、体色鲜艳，具有显明的发展和抗病上风，深受养殖户和花费者爱好。李忠研讨员团队依据养殖户和花费者需求，应用家系选育方式开展了年夜黄斑鳝新品种选育，今朝已选育到第三代，体色一致率到达了80%以上。黄鳝全人工繁育技巧的冲破以及高质量基因组解析应用，将极年夜增进品种选育进度，年夜黄斑新品种有看近年内经由过程国度核定。
该论文第一作者为田海峰博士，通信作者为李忠研讨员，研讨获得中国海产科学研讨院基础科研营业费赞助。论文具体链接为：
https://doi.org/10.1093/g3journal/jkaa032。
（出处：中国海产科学研讨院）
